Nel 1975 Francesco Ernani è il vincitore del concorso pubblico al Teatro alla Scala quale Direttore degli Affari Generali e del Personale fino al 1980, quando ne diviene il Segretario Generale. Nel 1986 è chiamato come Sovrintendente all’Arena di Verona, incarico che terrà fino al 1990 quando assumerà il medesimo incarico al Teatro Carlo Felice di Genova.
Assume la Sovrintendenza del Teatro del Maggio Musicale Fiorentino nel 1994 per approdare il primo luglio del 1999 e fino all'Aprile del 2009 al Teatro dell'Opera di Roma che, sotto la sua gestione, ottiene il premio “Oscar di Bilancio e della Comunicazione Non Profit 2001”. Nel 2009 è stato consulente del Teatro Massimo “V. Bellini” di Catania.
Da gennaio 2011 è Sovrintendente del Teatro Comunale di Bologna.
