Gianmario Borio si è laureato in Filosofia all'Università di Torino e si è addottorato in Musicologia alla Technische Universität di Berlino. Ha usufruito di borse di ricerca da parte del DAAD, della Fondazione Paul Sacher e della Fondazione Alexander von Humboldt. Dal 1993 è professore presso la Facoltà di Musicologia dell’Università di Pavia. E’ stato docente ospite presso diverse facoltà in Europa e Stati Uniti. Nel 1999 la Royal Musical Association gli ha conferito la Dent Medal. È membro del comitato di redazione delle riviste «Acta Musicologica» e «Il Saggiatore Musicale». È coordinatore nazionale del progetto di ricerca di interesse nazionale Storia dei concetti musicali e responsabile della sezione italiana dello European Network for Musicological Research. Le sue pubblicazioni affrontano diversi aspetti della composizione nel XX secolo, della teoria e dell’estetica musicale.
