Nato a Navarra nel 1957, Francisco Mangado si è laureato presso l'Università di Navarra nella Facoltà di Architettura nel 1982.
Ha tenuto lezioni anche nella Graduate School of Design della Harvard University.
Parallelamente sviluppa il suo lavoro di architetto nel suo studio a Pamplona.
Dal giugno 2008 promuove la Fundación Arquitectura y Sociedad.