Marco Filicori è nato a Bologna il 27 luglio 1952 ed in questa stessa città ha compiuto gli studi medi superiori, presso il Liceo Scientifico A. Righi. Si è iscritto alla Facoltà di Medicina e Chirurgia dell'Università di Bologna nel 1971 e si è laureato il 30 giugno 1977 con punti 110 su 110 e lode, discutendo la Tesi dal titolo L'organizzazione dei Servizi di Pianificazione Familiare. Nel novembre 1977 ha superato l'esame di Stato per l'abilitazione alla professione medica e dal gennaio 1978 è iscritto all'Ordine dei Medici di Bologna.