Natale Ammaturo ha organizzato numerosi convegni nazionali riguardanti i giovani, i rapporti tra generazioni, i rapporti scuola–famiglia. Ha progettato e diretto corsi di formazione per insegnanti organizzati dall'IRRSAE Campania. Ha progettato e diretto il corso di perfezionamento post lauream Metodologia e tecnica della ricerca educativa e interconnessioni con il P.E.I. Ha coordinato una ricerca sull'aggiornamento degli insegnanti per conto dell'IRRSAE Campania. Ha fondato e dirige la rivista a diffusione nazionale «ReS–Ricerca e sviluppo per le politiche sociali». Il suo lavoro teorico–metodologico tende ad approfondire i temi riguardanti la sociologia dell'educazione e della formazione nel postmoderno. Partecipa a una ricerca europea sul rafforzamento delle strategie di sostegno alle scuole rurali e periferiche.