Franz Fischer è amministratore delegato del Centro di Colonia per eHumanities (CCEH) dell'Università di Colonia. Si occupa oltre a vari progetti di ricerca nazionali ed internazionali, ianche del progetto UE Dixit - Digital Editions Scholarly formazione della rete iniziale. Ha inoltre incarichi di insegnamento regolari presso l'Università di Colonia e del programma di Master, e presso la Facoltà di Umanistica presso la National University of Ireland Maynooth (NUIM).
Da settembre 2008 ad agosto 2011 ha lavorato come direttore ed editore della Saint Patrick presso la Royal Irish Academy lavorato di Dublino.
In precedenza è stato un associato presso la Thomas-Institut dirigendo l'ufficio del Centro di Studi Medievali presso l'Università di Colonia. Ha inoltre ricoperto incarichi di insegnamento per il Dipartimento di Informazioni storico-culturale di elaborazione presso l'Università di Colonia e il Dipartimento di Storia presso l'Ruhr di Bochum.
Ha conseguito una tesi di dottorato presso il Dipartimento di Filologia latina del Medioevo dell'Università di Colonia, “Prima edizione critica digitale del Summa de officiis ecclesiasticis di Guglielmo di Auxerre”. Dal 2014 è membro del Comitato esecutivo e dal 2015 è editore della rivista online «Medievalist».
